在《办法》发布的同时，银保监会配套印发了《关于做好商业银行股权托管办法实施相关工作的通知》，对商业银行股权托管和股权确权工作明确了过渡期安排。对于股权托管，设置了过渡期，未托管的商业银行应在2020年6月底前按《办法》要求完成托管，已托管、但不符合《办法》要求的，应在同一时间期限内完成整改；对于股权确权，应当与股权托管工作同时进行，商业银行应在2020年6月底前完成不低于80%的股权确权，在2021年12月底前完成全部股权的确权（因特殊原因无法确权的除外）。
银保监会有关部门负责人表示，银保监会根据《银行业监督管理法》，从审慎监管角度，要求未上市的商业银行按照市场化原则将股权托管至依法设立的证券登记结算机构、符合《办法》规定且不在黑名单中的区域性股权市场运营机构或其他股权托管机构。
